Ответ: Да, средства будут списываться.
Согласно приложению к постановлению Совета Министров Республики Беларусь, Национального банка Республики Беларусь от 28.06.2019 № 432/11 «Об автоматизированной информационной системе исполнения денежных обязательств» под счетом в банке понимается счет, открытый на основании договора, заключенного с банком в порядке, установленном банковским законодательством, в том числе счет по учету вклада (депозита), за исключением счетов в банках, взыскание денежных средств с которых в бесспорном порядке законодательными актами не предусмотрено.
Банковский счет открывается не филиалу (представительству), а юридическому лицу (ст. 198 Банковского кодекса Республики Беларусь).
Вместе с тем нужно помнить, что АИС ИДО была создана Указом Президента Республики Беларусь от 16.10.2018 № 414 «О совершенствовании безналичных расчетов» и в его исполнение было принято вышеназванное постановление № 432/11. Под плательщиками, согласно Указу № 414, понимаются юридические лица, в том числе осуществляющие исполнение их денежных обязательств филиалы, представительства и иные обособленные подразделения юридических лиц, организации, не являющиеся юридическими лицами.
Таким образом, денежные средства также будут списываться посредством АИС ИДО на основании принятых к исполнению платежных требований взыскателя со счетов в банках, открытых должнику для обеспечения деятельности его филиалов.